Nội dung điều tra tập trung chủ yếu vào số lượng và các chỉ tiêu cơ bản, gồm tên gọi, địa điểm, loại hình cơ sở, hình thức sở hữu, loại hình tổ chức hoạt động, ngành nghề sản xuất kinh doanh... của các cơ sở kinh tế (trừ các đơn vị thuộc ngành nông, lâm, ngư nghiệp đã điều tra trong tổng điều tra nông thôn, nông nghiệp và thủy sản năm 2006), các cơ quan hành chính, sự nghiệp, các tổ chức Đảng, đoàn thể, hiệp hội... trên phạm vi cả nước.
Đợt điều tra lần này cũng xoay quanh số lượng, trình độ chuyên môn của lao động, một số chỉ tiêu về thống kê giới; kết quả hoạt động sản xuất kinh doanh (thu nhập, doanh thu, nguồn vốn, tài sản... ); các chỉ tiêu chủ yếu về tình trạng trang thiết bị, ứng dụng công nghệ thông tin...
Kết quả sơ bộ của tổng điều tra được công bố vào tháng 12/2007, kết quả điều tra chính thức được công bố vào tháng 7/2008.
Ban Chỉ đạo tổng điều tra cơ sở kinh tế, hành chính, sự nghiệp cấp Trung ương, do Tổng cục trưởng Tổng cục Thống kê làm Trưởng ban, và cấp tỉnh sẽ được thành lập để chỉ đạo, tổ chức thực hiện tổng điều tra.